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拉曼组遇到三代测序 | 星赛生物与希望组达成战略合作,共同推出微生物单细胞测序分析服务

2021.06.03

2021年5月28日,借助在南京召开中国肠道大会的契机,国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心主任星赛生物联合创始人)徐健研究员与希望组生物CEO汪德鹏举行会谈。双方达成战略合作协议,本着“优势互补、资源整合、协同创新”的目标,隆重推出基于拉曼光谱的微生物单细胞分选与测序分析服务,创新性地将单细胞拉曼光谱技术运用于单细胞功能分选,并与长读长测序技术耦合,为微生物探微工程领域挖掘生命暗物质资源、深入探索尚难培养微生物世界,提供全新的技术支撑平台。双方的此次合作,将推动微生态科学研究领域发展,并促进该技术在医学、环境、海洋、农业等产业领域的应用。


单细胞测序技术开始发表至今,已逐渐成为一种成熟的测序手段,很好地解决了样本异质性问题,并将分析水平提升至了单细胞维度,广泛应用于动植物以及人类样本中。但由于众多难以分离培养等限制,单细胞微生物组学充满挑战单细胞拉曼分选技术,是基于微流控芯片的流式RACS技术,通过集成基于介电的单细胞捕获释放和电磁阀吸吮技术,实现了高速流动状态下单细胞的捕获、拉曼采集、释放和分选,单细胞经液滴包裹后,不仅可以保护细胞免受分选过程中的损伤,还可与分选后细胞的培养、DNA、RNA、蛋白等的提取与分析等无缝衔接。长读长测序技术,以PacBio sequel II和Oxford Nanopore PromethION为代表的高通量测序系统,凭借单分子、长读长、高通量、直接检测碱基修饰等优势,已在基因组学、转录组学、表观组学、单细胞等各个研究方向有着广泛深入的应用。

此次双方合作推出的单细胞微生物测序产品,正是结合单细胞、拉曼光谱、长读长各自的优势。基于单细胞拉曼成像的拉曼组(Ramanome)技术能够非标记、非破坏性地识别与分析广泛的细胞功能。单细胞拉曼分选技术,通过原创仪器和软件,实现了拉曼采集、分析、单细胞液滴包裹及分选的高度自动化。之后,结合单分子长读长测序技术,获取更完整的微生物单细胞基因组、转录本序列。通过多维度的数据采集,一次实验可同时获得微生物拉曼光谱数据和单细胞长读长测序数据,可联合分析,在单细胞水平多维度研究微生物分类、进化、基因功能等。

关于希望组

希望组(Grandomics)是全球知名的三代测序技术拓展者,成立于2011年8月8日,曾用“未来组”品牌开拓三代测序科技服务,是中国首家三代测序服务公司。多年来,一直专注于在领先的三代测序平台上进行技术开发与应用拓展,目前,已经形成了“科技服务”、“诊断服务”、“生物信息”、“先进制造”四大业务模块;在北京、武汉建设了合计超过7,000平米的科研服务平台、医学检验实验室与GMP生产厂房;引进了国际先进的ONT PromethION 48、PacBio Sequel II、MGISEQ2000、Bionano Saphyr光学图谱等技术平台;自主开发了NextDenovo/NextPolish系列三代测序组装软件,GrandSV/NextSV结构变异分析系统软件,GrandPathogen病原微生物检测软件,GrandBox遗传病大数据分析系统软件,SCAN-seq三代测序单细胞测序技术、Pore-C/Hi-C新一代三维基因组技术,LAMP-Pore纳米孔新冠病毒快速检测技术,dbSV人类基因组结构变异数据库;同时构建了华为云三代测序高性能计算集群,为客户提供优质的第三代测序分析和存储服务。公司核心团队均是三代测序领域多年技术与应用资深专家,硕博占比超过50%。2020年自然指数年度榜单,希望组位列中国测序行业第二名。





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