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星赛生物助力中国海洋大学等揭开高原真核微生物极端适应的分子密码

2026.04.29
Natl Sci Rev


近日,中国海洋大学海洋生物多样性与进化研究所、水产学院龙红岸团队联合星赛生物等14家国内外科研机构,从海拔 4533 米的西藏依布茶卡盐湖,分离出一株能同时扛住高盐、低温、低氧的纤毛虫原生动物——Apourosomoida sp. LHA081A01,并全面阐明了其耐受多重极端环境胁迫的分子机制与演化。
相关研究发表于 National Science Review《国家科学评论》。
这项成果不仅刷新了我们对 “生命极限” 的认知,更用单细胞拉曼光谱等技术,直接 “看见” 了纤毛虫原生动物体内海藻糖、β-胡萝卜素含量,验证了关键“抗压神器”——TreT酶的功能,为极端环境适应研究提供了全新范式。

青藏高原盐湖是全球极具代表性的高海拔极端环境,兼具高盐、低温、低氧、强紫外辐射等多重胁迫,是探索生命极限适应机制的天然实验室。

解析生物如何在极端环境下生存,尤其是那些可同时耐受多种极端环境的多重嗜极生物,对于理解生命极限、以及应对全球气候变化带来的多重环境胁迫具有重要科学价值。

极端禁区里的 “生存王者”


青藏高原上分布着数以千计的湖泊,这些环境普遍具有高盐、高重金属离子、低氧、强紫外辐射、温度波动剧烈等特征,是天然的 “演化熔炉”,很可能孕育出区别于其他生境、可同时耐受多重胁迫的独特多重嗜极生物。

研究人员从海拔 4533 米的西藏依布茶卡盐湖分离获得一种纤毛虫原生动物—— Apourosomoida sp. LHA081A01 纤毛虫,是罕见可同时耐受高盐、低温与低氧的多重嗜极真核微生物。

由于技术限制,这些多重嗜极微生物的生存策略长期以来是一个未解之谜

Fig. 1 Apourosomoida sp. 形态特征、生理响应与存活实验

跨域 “借” 基因,打造抗逆神器


研究人员通过基因组、转录组、代谢组联合解析,揭开了这种纤毛虫原生动物的生存密码:

Fig. 2 Apourosomoida sp. 基因组组装与比较分析


水平基因转移:从细菌 “借来” 海藻糖合成能力

研究团队解析了纤毛虫特殊的“纳米染色体”(nanochromosomes,一条染色体只携带1–2个基因)基因组,并找到了关键的“抗压神器”——海藻糖糖基转移(TreT)酶。

演化分析显示,在约6215万年前,其祖先通过“水平基因转移”,从一类严格厌氧嗜盐细菌脱硫杆菌中“借”来了该基因。这一基因在绝大多数纤毛虫中均不存在。

TreT酶能够介导海藻糖(α,α-trehalose)的合成,而海藻糖是一种天然蛋白质稳定剂,可同时抵御高盐、低温、低氧三重胁迫。

更精妙的是,该基因扩增为 3 个拷贝并实现功能分化:

  • TreT 1709.1:融入核心代谢网络,承担广泛的胁迫耐受功能

  • TreT 6901.1:专一应对缺氧胁迫

  • TreT 9057.1:原始拷贝,基本丧失抗逆功能

Fig. 3 Apourosomoida sp. 抗逆机制与进化模式

Fig. 4 Apourosomoida sp. 中 TreT 基因的水平转移与功能验证

Fig. 5 三个 TreT 基因 RNAi 敲低后的细胞存活与氧化应激检测

    β-胡萝卜素:天然抗氧化护盾

    纤毛虫大量积累 β-胡萝卜素,高效清除环境胁迫产生的活性氧(ROS),构建第二层抗逆防线。

    极简基因组:适配极端环境

    纳米级染色体、高 GC 含量、少内含子,大幅降低能量消耗,配合胁迫响应基因家族扩张,实现快速环境适应。



    原位 “看见” 抗逆代谢物

    关键抗逆代谢物一直缺乏原位、活体、单细胞层面的直接证据。传统代谢检测方法需破碎细胞、提取纯化,易破坏细胞天然状态,难以反映真实生理水平。单细胞拉曼光谱凭借非标记、无损、单细胞分辨率的优势,可在保持细胞完整存活的前提下,直接捕获分子特征指纹,精准识别代谢物质,成为本研究中鉴定核心抗逆物(β-胡萝卜素、海藻糖)的关键技术。

    单细胞拉曼光谱的结果,进一步与高分辨电喷雾质谱(HRESIMS)、高效液相色谱(HPLC)交叉验证,形成可靠证据链,为阐明海藻糖合成基因跨域转移、代谢物协同抗逆的极端适应机制提供了重要支撑。


    β-胡萝卜素

    在拉曼光谱中出现典型共轭多烯强特征峰,图 i 红色虚线所示。

    海藻糖

    在拉曼光谱中出现糖类特征指纹峰,图 j 红色虚线所示。



    全球协作赋能,助力iMAPS计划拓展研究范式

    当前,单细胞原位代谢图谱科学计划(iMAPS;www.iMAPS.info)正在全球建设 70 余个微生物组代谢功能探测节点,旨在规模化、系统性地产出海量拉曼组 / 元拉曼组大数据,构建原位功能菌种库。本研究不仅建立了极端环境真核微生物单细胞代谢表型原位识别与功能验证体系,更为高原微生物胁迫适应机制解析、跨域水平基因转移功能验证、极端功能酶挖掘提供了可复用、可推广的技术范式,在极端环境生命机制研究、高原生态监测、抗逆元件开发、气候变化生物学等领域具有广阔应用前景。
    本研究是 iMAPS 五大板块中环境领域的重要应用范例,更为极端微生物功能研究提供了一个可复制、可借鉴的研究思路与技术路径。
    这项工作不仅将高海拔真核微生物推向了极端生物的研究前沿,也为解析极端生命的分子适应策略提供了重要视角。研究进一步前瞻性的指出,在全球变暖背景下,青藏高原冰川加速融化导致的盐湖降盐及区域升温,可能对该原生动物构成严峻挑战——尽管其具备多重抗逆能力,却无法在低盐度或淡水中长期存活。这一发现为理解气候变化如何重塑高海拔真核微生物的命运提供了生动范例。
    作为专注于单细胞功能表型解析与功能细胞分选装备的创新企业,星赛生物深耕单细胞拉曼光谱领域,以非标记、单细胞、高通量、无损的核心优势,已广泛用于微生物代谢表型、极端环境适应、菌株筛选等研究,为生命科学提供 “看得见” 的硬核工具。
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